Российские ученые разработали метод поиска мутантных белков, которые приводят к развитию рака. Результаты исследования опубликованы в издании Proteomics.
Мутации ДНК приводят к точечным заменам аминокислот в клетках, что впоследствии провоцирует рак. Изучение мутантных белков поможет медикам найти слабые места злокачественных клеток и разработать эффективные лекарства от онкологических заболеваний.
Главный метод выявления мутантных белков – масс-спектометрический анализ, позволяющий определить точную массу молекул, а также их химический состав. Специально разработанная программа сравнивает полученные результаты масс-спектомектрии с базой данных белков всего организма, выявляя таким образом видоизмененные клетки.
Однако аминокислотная последовательность некоторых белков отличается от эталонного генома. Поэтому биохимики разработали алгоритм, использовавший для анализа не только базы данных белков, но и базы данных генома определенных клеток. Исследователи учли белки с нестандартными последовательностями аминокислот, благодаря чему сумели выявить «больные» белки.
Свою систему ученые проверили по геномной базе данных клеточной линии НЕК-293, которую получили из эмбриона человека, модельной культуре клеток, нередко используемой в исследованиях.
Читайте также: