Ученые из Школы морских и атмосферных наук им. Розенштиля (США) открыли 230 ранее неизвестных гигантских вирусов в наборах морских метагеномных данных. Для этого они использовали высокопроизводительные вычислительные методы.
В геномах вирусов выявили 530 функциональных белков. Девять из них участвовали в фотосинтезе. Это указывает, что вирусы способны манипулировать хозяином и процессом фотосинтеза после заражения.
Гигантские вирусы в океане играют важную роль в выживании одноклеточных организмов, таких как водоросли, амебы и жгутиковые. Они также являются основной причиной гибели многих видов фитопланктона, которые служат основой пищевой сети. Открытие новых вирусов позволит лучше понять их свойства. Кроме того, оно может иметь биотехнический потенциал, так как некоторые функции представляют собой новые ферменты.
Для поиска вирусов ученые создали инновационный инструмент BEREN (Биоинформационный инструмент для извлечения эукариотических вирусов из метагеномов окружающей среды). Он позволяет идентифицировать гигантские вирусные геномы в общедоступных наборах данных.
Группа загрузила данные секвенирования ДНК, собранные в рамках девяти крупных проектов. Места сбора проб охватили территорию от полюса до полюса.
Результаты показали, что гены гигантских вирусов участвуют во многих клеточных функциях, таких как метаболизм углерода и фотосинтез. Это позволяет им влиять на морскую биогеохимию, сообщает Nature npj Viruses.
Ранее неизвестный науке гигантский вирус нашли в Финляндии. Диаметр вирусной частицы составил 200 нанометров – в два раза больше, чем у вирусов гриппа и коронавируса. Вирус оказался связан с марсельвирусами, ранее выделенными во Франции. Он регулировал микробные сообщества в почве.